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Il y a trois branches de l'inquisition, avec chacune une chambre militante :
- L'Ordo Malleus (chasseurs de démons), qui lutte contre les démons, dont la chambre militante est le chapitre bien particulier des chevaliers gris.
- L'Ordo Hereticus (chasseurs de sorcières), qui lutte contre les hérétiques, dont la chambre militante est les différents couvents de Soeurs de Batailles.
- L'Ordo Xenos, qui lutte contre les extra-terrestre, dont la chambre militante est la Deathwatch, une force composée de Marines issus de chapitres divers et variés, qui repeignent leur armure en noir, sauf l'épaulette gauche, et récupèrent une épaulette droite caractéristique :
Les Soeurs de Bataille sont clairement à part, tout d'abord parce qu'il ne s'agit pas de Space Marines, et surtout parce qu'en plus d'être la chambre militante de l'Ordo Hereticus, elles sont aussi le bras armé de l'Éclésiarchie.